农学院华跃进教授团队揭示RNA成熟关键酶催化新机制

编辑:admin 时间:2015年05月11日 访问次数:2093

RNA降解体是rRNA成熟和mRNA降解过程中的一个重要的酶复合体。在以大肠杆菌为代表的革兰氏阴性菌中,RNase E中关键的核糖核酸酶,而RNase J作为RNase E的同功蛋白在革兰氏阳性菌的RNA加工过程中起着关键性的作用。RNase J属于β-CASP家族蛋白,同时具有核酸内切酶(endo)以及5-3核酸外切酶(exo)活性,在rRNA成熟和mRNA降解中起着至关重要的作用。目前,RNase J蛋白的催化及其endo/exo活性转换的机制尚不清楚。
华跃进教授团队经过三年的研究,成功结晶并解析获得了耐辐射球菌RNase JRNA复合体的高分辨率晶体构象,并进行了相应的体内外实验验证。结果表明RNase J使用锌离子进行双金属离子催化反应;RNase J存在一个保守基序能够与底物RNA5′端磷酸基团互作,对于反应产物的稳定有着重要的作用;同时,锰离子介导了该蛋白二聚化的过程,对调控其endo/exo活性起到了至关重要的作用。这些结果成功阐明了RNA成熟关键酶RNase J蛋白的催化和活性转换机制,并首次为细胞内高浓度锰离子调控RNA代谢相关酶活性提供了直接证据。
该研究成果论文“Structural insights into catalysis and dimerizationenhanced exonuclease activity of RNase J”已于近期在Nucleic Acids Research杂志(IF2014=8.81)上在线发表http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2015/05/04/nar.gkv444.full华跃进教授为通讯作者,赵烨副教授、博士研究生卢梅华和张慧为该论文的共同第一作者。该研究得到了国家重大研究计划和国家自然科学基金等项目的资助。
(原子核农业科学研究所)
RNA成熟关键酶RNase J蛋白的催化机制。A. RNA与侧链残基互作的电子密度图;B. RNase J 双金属离子催化反应机制。