植物病理：

1.植物源性食品病原生物芯片检测技术研究（国家高技术研究发展计划）

2.高通量克隆鉴定与水稻抗病反应有关的转录因子（国家自然科学基金）

3.水稻系统获得抗病性中MAPK信号传导途径组分的克隆鉴定（国家自然科学基金）

4.水稻细菌性谷枯病病害风险评估（国家基金）

5.洋葱伯克氏菌作为生防菌的风险分析（国家基金）

6.中国粉虱传双生病毒致病性变异及病害流行的分子基础（国家自然科学基金）

7.与粉虱传双生病毒伴随的DNA-beta分子的C1 ORF的功能研究（国家自然科学基金）

8.双生病毒遗传变异与进化的分子机制及病毒高效表达载体构建（国家杰出青年基金）

9.农作物重大病虫害成灾机理及调控基础的研究（国家科技部）

10.植物病毒基因组结构、功能及抗病毒基因工程（教育部高等学校优秀青年教学和科研奖励基金）

11.水稻诱导抗病性相关基因的功能分析（教育部优秀青年教师计划）

12.水稻有害生物普查与风险分析（农业部）

13.重要经济作物病毒检测技术及脱毒应用平台建立（浙江省科技厅成果转化）

14.小麦矮化病毒基因结构调查（中德农业科技合作项目）

15.利用生防菌治理水稻和蔬菜主要土传病害（比利时政府）

16.水稻系统获得抗性分子生物学（国际科学基金）

农业昆虫与害虫防治：

1.转基因作物农田生态系统生物群落结构的研究（973）

2.稻水象甲入侵生物种群形成与扩张的生态机制（国家重点基础研究发展规划(973计划)“农林危险生物入侵机理及控制基础研究”）

3.昆虫对有毒化学物质的分子适应及其机理（国家基金重点项目）

4. 水稻姜烯对水稻与二化螟互作的调控及其合成酶基因研究（国家自然科学基金）

5.水稻抗螟虫数量性状基因座位(QTL)及其遗传效应分析（国家自然科学基金）

6.转基因抗虫水稻对二化螟天敌胁迫作用的评价（教育部优秀博士论文基金）

7.Bt籼稻抗虫性研究（国际水稻研究所）

8.利用分子标记提高水稻对螟虫的持久抗性（美国自然保护-食品-健康基金）

9.内寄生蜂毒液的生理功能及其重要生理活性物质的分析（浙江省人才基金）

10转基因水稻抗矮缩病毒田间试验（北京大学）

生物物理：

1.优质超级三系杂交水稻新组合的选育（863）

2.优质超级两系杂交水稻新组合的选育（863）

3.富铁、富GABA功能性稻米的选育与开发（国家科技部）

4.新颖食品研究与评价（欧盟第6研究框架）

5.水稻糊化温度突变基因的特性专化与分子定位（国际原子能机构）

6.诱变剂对转基因水稻中控制直链淀粉含量和潮霉素抗性基因的影响（国际原子能机构）

7.诱变剂对（转基因）水稻中直链淀粉含量和潮霉素抗性基因的影响（国际原子能机构）

8.转Bt基因稻米的化学指纹图、全营养和理化特性研究（国家自然科学基金）

9.彩叶草坪草资源的评价与利用（国家自然科学基金）

10.彩色系列草坪草新品种培育及产业开发（浙江省科技厅）

11.优质水稻辅助选择技术及种质创新（浙江省科技厅）

12.苗期携带白化转绿型叶色标记杂交稻不育系及系列放心组合（浙江省科技厅）

13.功能与环保形低植酸玉米选育与利用（浙江省科技厅）

14.主要杂交作物亲本标记改良及组合选配（北京大北农集团）