| 序号 | 项目类型 | 项目名称 | 负责人 | 执行时间 |
| 1 | 重点 | 柑桔果实品质形成规律研究 | 张上隆 | 1998-2000 |
| 2 | 面上 | 果树LEAFY同源基因对童期幼苗开花的促进作用 | 陈大明 | 1998-2000 |
| 3 | 面上 | 木本植物空间发育模式及机理 | 李载龙 | 1998-2000 |
| 4 | 面上 | 成熟猕猴桃果实中全长LOX 基因克隆与表达研究 | 陈昆松 | 1999-2001 |
| 5 | 面上 | 温度胁迫限制柑桔光合作用的机理 | 郭延平 | 2000-2002 |
| 6 | 面上 | 蔬菜茄红素代谢基因工程 | 陈大明 | 2001-2003 |
| 7 | 面上 | 果树LEAFY同源基因功能及其提早木本植物开花研究 | 陈力耕 | 2001-2003 |
| 8 | 青年 | 果实组织特异性启动子的分离及功能鉴定 | 徐昌杰 | 2002-2004 |
| 9 | 面上 | 柑桔果实糖积累的分子生理机理研究 | 张上隆 | 2002-2004 |
| 10 | 面上 | 果实后熟软化进程中脂氧合酶的分子生理功能及其调控 | 陈昆松 | 2002-2004 |
| 11 | 面上 | 1-MCP和SA对果实后熟软化进程调控的分子生理机制 | 陈昆松 | 2003-2005 |
| 12 | 面上 | 红肉脐橙果实积累番茄红素的分子基础研究 | 徐昌杰 | 2004-2006 |
| 13 | 面上 | 中国原产梨属植物系统关系及白梨品种起源的研究 | 滕元文 | 2004-2006 |
| 14 | 面上 | 柑橘光合机构光破坏与防御机理 | 郭延平 | 2005-2007 |
| 15 | 面上 | 猕猴桃果实成熟衰老进程中两个乙烯受体基因的表达与调控 | 陈昆松 | 2006-2008 |
| 16 | 面上 | 柑桔果实类胡萝卜素合成关键基因鉴别及其表达特性研究 | 徐昌杰 | 2007-2009 |
| 17 | 面上 | 采后枇杷果实木质化4个相关基因的协同表达与调控研究 | 李 鲜 | 2007-2009 |
| 18 | 面上 | 果实香气形成特异LOX基因家族成员的鉴别及其调控 | 陈昆松 | 2008-2010 |
| 19 | 面上 | 应用SSR分子标记解析水蜜桃果实风味性状的遗传控制 | 高中山 | 2008-2010 |
| 20 | 面上 | 柑橘低二氧化碳同化的机理研究 | 郭延平 | 2008-2010 |
| 21 | 面上 | 枇杷果实类胡萝卜素积累的分子生理机制 | 徐昌杰 | 2009-2011 |
| 22 | 青年 | 桃果实冷害过程膜脂代谢相关基因的协同表达机制 | 张 波 | 2009-2011 |
| 23 | 青年 | 杨梅果实花青苷降血糖功能组分及其生物效价研究 | 孙崇德 | 2009-2011 |
| 24 | 面上 | 中国梨属植物遗传多样性及主要栽培系统的演化研究 | 滕元文 | 2009-2011 |
| 25 | 面上 | 枇杷果实采后衰老与冷害过程乙烯信号转导元件基因表达调控 | 李 鲜 | 2009-2011 |
| 26 | 面上 | 果实ETRs 和EIN3/EILs 的采后非生物胁迫应答机制与调控 | 陈昆松 | 2010-2012 |
| 27 | 面上 | 桃果实过敏原特异基因成员鉴别及遗传多样性分析 | 高中山 | 2010-2012 |
| 28 | 重点 | 基于ERFs基因家族成员的果蔬保鲜生物学机理研究 | 陈昆松 | 2011-2014 |
| 29 | 面上 | MYB和bHLH杨梅果实花青苷合成的转录调控及其机制研究 | 徐昌杰 | 2011-2013 |
| 30 | 小额 | 红色砂梨花青苷合成的分子机理及调控 | 滕元文 | 2011-2011 |
| 31 | 面上 | 桃果实青香型香气向果香型香气转化的分子机理与调控 | 张 波 | 2012-2015 |
| 32 | 面上 | 杨梅果实花青苷抗氧化活性及其抗肿瘤效应研究 | 孙崇德 | 2012-2015 |
| 33 | 青年 | 基于乙烯信号转导途径的采后柿果实涩味脱除机制研究 | 殷学仁 | 2012-2014 |
| 34 | 面上 | 基于启动子序列变异和DNA甲基化分析的红梨花青苷合成相关基因转录调控机制研究 | 滕元文 | 2013-2016 |
| 35 | 青年 | 基于COS标记和STS标记的梨属植物系统发育研究 | 蔡丹英 | 2013-2015 |
| 36 | 面上 | 桃果实主要过敏原脂质转移蛋白品种间变异和全基因组 | 高中山 | 2013-2016 |
| 37 | 面上 | 转录因子MYB介导的枇杷果实采后木质化及其调控机制研究 | 陈昆松 | 2014-2017 |
| 38 | 面上 | 酰基辅酶A氧化酶与脂质转移蛋白在桃果实内酯类香气生物合成中作用 | 贾惠娟
| 2014-2017 |
| 39 | 面上 | NAC与ERF协同转录调控柿果实采后脱涩的机制研究 | 殷学仁 | 2014-2017 |
| 40 | 面上 | ERF转录调控柑橘果实萜类芳香物质形成的机制 | 张 波 | 2014-2017 |
| 41 | 面上 | 杨梅雌雄性别决定的遗传和基因组学基础 | 高中山 | 2015-2018 |
| 42 | 面上 | 采后枇杷果实冷害木质化的HSF转录调控分子机制研究 | 李 鲜 | 2015-2018 |
| 43 | 面上 | 可见光和UV-B协同诱导梨果皮花青苷合成的光信号应答分子机制研究 | 滕元文 | 2015-2018 |
| 44 | 青年 | 枇杷果肉木质化形成过程的拉曼/红外定量显微可视化研究 | 吴 迪 | 2015-2018 |
| 45 | 青年 | 不同色系菊花花青苷差异积累的MBW转录复合体调控机制 | 刘晓芬 | 2015-2018 |
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