1.研究论文（*为通讯作者）

1)Xu X-H, Wang C, Li S-X, Su Z-Z, Zhou H-N, Mao L-J, Feng X-X, Liu P-P, Chen X, Snyder JH, Kubicek CP, Zhang C-L*, Lin F-C. Friend or foe: differential responses of rice to invasion by mutualistic or pathogenic fungi revealed by RNAseq and metabolite profiling. Scientific Reports, 2015, 5: 13624. (SCI, 5-Year Impact Factor=5.597)

2)Wang JY, Wang GP, Zhang YL, Zheng BQ, Zhang CL, Wang LW*. Isolation and identification of an endophytic fungus Pezicula sp. in Forsythia viridissima and its secondary metabolites. World Journal of Microbiology & Biotechnology, Oct 2014, 30(10): 2639-44. (SCI, 5-Year Impact Factor=1.686)

3)Xu X-H, Su Z-Z, Wang C, Kubicek CP, Feng X-X, Mao J-L, Wang J-Y, Chen C, Lin F-C, Zhang C-L*. The rice endophyte Harpophora oryzae genome reveals evolution from a pathogen to a mutualistic endophyte. Scientific Reports, 2014, 4 : 5783. (SCI, 5-Year Impact Factor=5.597)

4)Wang JY, Xu XH, Mao LJ, Lao JP, Lin FC, Yuan ZL, Zhang CL*. Endophytic Diaporthe from Southeast China are genetically diverse based on multi-locus phylogeny analyses. World Journal of Microbiology & Biotechnology, JAN 2014, 30(1): 237-243. (SCI, 5-Year Impact Factor=1.686)

5)Su ZZ, Mao LJ, Li N, Feng XX, Yuan ZL, Wang LW, Lin FC, Zhang CL*, Evidence for biotrophic lifestyle and biocontrol potential of dark septate endophyte Harpophora oryzae to rice blast disease. PLoS One, APR 2013, 8(4): e61332. (SCI, 5-Year Impact Factor=3.702)

6)Zhang LP, Wang JS, Zhang CL, Wang QM. Analysis of potential fumonisin-producing Fusarium species in corn products from three main maize-producing areas in eastern China. Journal of The Science of Food and Agriculture, FEB 2013, 93(3): 693-701 

7)Yuan ZL*, Chen YC, Xu BG, Zhang CL*. Current perspectives on the volatile-producing fungal endophytes. Critical Reviews in Biotechnology, DEC 2012, 32(4): 363-373. (SCI, 5-Year Impact Factor=6.854)

8)Zhao JH, Zhang YL, Wang LW, Wang JY, Zhang CL*. Bioactive secondary metabolites from Nigrospora sp. LLGLM003, an endophytic fungus of the medicinal plant Moringa oleifera Lam. World Journal of Microbiology and Biotechnology, MAY 2012, 28(5): 2107-2112. (SCI, 5-Year Impact Factor=1.596)

9)Wang LW, Xu BG, WANG JY, Su ZZ, Lin FC, Zhang CL*, Kubicek CP. Bioactive metabolites from Phoma species, an endophytic fungus from the Chinese medicinal plant Arisaema erubescens. Applied Microbiology and Biotechnology, FEB 2012, 93(3): 1231-1239. (SCI TOP, 5-Year Impact Factor=3.848) 

10)Liu XH, Yang J, He RL, Lu JP, Zhang CL, Lu SL, Lin FC*. An autophagy gene, TrATG5, affects conidiospore differentiation in Trichoderma reesei. Research in Microbiology, OCT 2011, 162(8): 756-763. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.978)

11)Wang LW, Zhang YL, Lin FC, Hu YZ, Zhang CL*. Natural products with antitumor activity from endophytic fungi. Mini-Reviews in Medicinal Chemistry, OCT 2011, 11(12): 1056-1074. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.845) 

12)Yuan ZL*, Rao LB, Chen YC, Zhang CL*, Wu YG. From pattern to process: species and functional diversity in fungal endophytes of Abies beshanzuensis. Fungal Biology, Mar 2011, 115(3): 197-213. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.405)

13)Jiang WM, Yang GM, Zhang CL*, Fu CX. Species composition and molecular analysis of symbiotic fungi in roots of Changnienia amoena (Orchidaceae). African Journal of Microbiology Research, FEB 2011, 5(3): 222-228. (SCI) 

14)Yuan ZL, Su ZZ, Mao LJ, Peng YQ, Yang GM, Lin FC, Zhang CL*. Distinctive endophytic fungal assemblage in stems of wild rice (Oryza granulata) in China with special reference to two species of Muscodor (Xylariaceae). Journal of Microbiology, FEB 2011, 49(1): 15-23. (SCI, 5-Year Impact Factor=1.543) 

15)Zhang CL, Wang GP, Mao LJ, Komon-Zelazowska M, Yuan ZL, Lin FC*, Druzhinina IS, Kubicek CP*. Muscodor fengyangensis sp. nov. from southeast China: morphology, physiology and production of volatile compounds. Fungal Biology,OCT 2010, 114(10): 797-808. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.177) 

16)Cheng JL, Zhou Y, Zhao JH, Zhang CL, Lin FC*. Synthesis and antifungal activity of trichodermin derivatives. Chinese Chemical Letters, SEP. 2010, 21(9): 1037-1040. (5-Year Impact Factor=1.022)

17)Yuan ZL, Lin FC, Zhang CL*, Kubicek CP. A new species of Harpophora(Magnaporthaceae) recovered from healthy wild rice (Oryza granulata) roots, representing a novel member of beneficial dark septate endophyte. FEMS Microbiology Letters, JUN 2010, 307(1): 94-101. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.448) 

18)Yuan ZL, Zhang CL*, Lin FC, Kubicek CP. Identity, diversity and molecular phylogeny of the endophytic mycobiota in rare wild rice roots (Oryza granulate) from a nature reserve in Yunnan, China. Applied and Environmental Microbiology, MAR 2010, 76(5): 1642-1652. (SCI TOP, 5-Year Impact Factor=4.359) 

19)Yuan ZL, Zhang CL*, Lin FC, Role of diverse non-systemic fungal endophytes in plant performance and response to stress: progress and approaches. Journal of Plant Growth Regulation, MAR 2010, 29(1): 116-126. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.581) 

20)He RL, Wang GP, Liu XH, Zhang CL*, Lin FC, Antagonistic bioactivity of an endophytic bacterium isolated from Epimedium brevicornu Maxim. African Journal of Biotechnology, JAN 2009, 8(2): 191-195. (SCI) 

21)Chen SY, Huang C, Zhang CL, Chen YZ, Lin FC*, Bostrycin, Acta Crystallographica Section E-Structure Reports Online, NOV 2008, 64: O2226-U2962. (SCI)

22)Li XL, Zhang CL, Fang WH, Lin FC*. White-spot disease of Chinese soft-shelled turtles (Trionyx sinens) caused by Paecilomyces lilacinus. Journal of Zhejiang University- Science B, JUL 2008, 9(7):578-581. (SCI, 5-Year Impact Factor=1.424)

23)Yan LY, Zhang CL, Ding LS, Ma ZH*, Development of a real-time PCR assay for the detection of Cladosporium fulvum in tomato leaves. Journal of Applied Microbiology, MAY 2008, 104(5): 1417 – 1424. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.657)

24)Chen SY, Zhang CL, Chen YZ, Lin FC*. Trichodermin (4β-acetoxy-12,13-epoxytrichothec-9-ene). Acta Crystallographica Section E-Structure Reports Online, APR 2008, 64: O702-U1286. (SCI)

25)Zhang CL, Zheng BQ, Lao JP, Mao LJ, Chen SY, Kubicek CP, Lin FC*, Clavatol and patulin formation as the antagonistic principle of Aspergillus clavatonanicus, and endophytic fungus of Taxus mairei. Applied Microbiology and Biotechnology, APR 2008, 78(5): 833-840. (SCI TOP, 5-Year Impact Factor=4.138)

26)Zhang CL, Liu SP, Lin FC*, Kubicek CP*, Druzhinina IS. Trichoderma taxi sp. nov., an endophytic fungus from Chinese yew Taxus mairei. FEMS Microbiology Letters, MAY 2007, 270(1): 90-96. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.448)

27)Zhang CL, Druzhinina IS, Kubicek CP, Xu T*. Trichoderma biodiversity in China: Evidence for a North to South distribution of species in East Asia. FEMS Microbiology Letters, OCT 15 2005, 251(2): 251-257. (SCI, 5-Year Impact Factor=2.448) 

28)毛黎娟，刘诚，章初龙*，王国平. 白色麝香霉挥发性有机化合物的抗菌活性和组成分析，菌物学报，2015，34(2): 269‐277.

29)徐旭辉，庄爱云，任海河，章初龙，王丽薇，王国平，木霉菌素的光稳定性及其降解产物分析，农药学学报，2014，16( 2) : 191-196.

30)王衬，毛黎娟，惠非琼，章初龙，楼兵干，林福呈，刘萍萍，陈霞，周会娜.不同氮素水平下内生真菌印度梨形孢定殖对烟草生长发育及物质代谢的影响.烟草科技, 2014(5): 76-81.（EI）

31)王丽薇，王国平，唐婷，邢旺兴，郑威，王靖，章初龙，一株无花果内生真菌及其次生代谢产物，2014, 33(5): 1084‐1093.

32)袁志林，王佳莹，章初龙，陈益存，陈连庆，一株植物内生无孢“类丝核菌”的鉴定方法，生物技术，2013，23( 6): 80-86.

33)王国平, 曾邵平, 徐彬, 章初龙*. 木霉菌素和嘧霉胺复配剂防治抗药性灰霉病.农药, 2013, 52(5): 377-379.

34)袁志林，陈益存，毛黎娟，章初龙*，陈连庆. 3 株产气内生真菌的水果防腐活性及其气体成分分析. 林业科学, 2013, 49(6): 83-89.

35)蔡庆秀，赵金浩，王佳莹，王丽薇，章初龙，辣木内生真菌LM033的分离鉴定及其代谢产物抗植物病原菌活性，中国新药杂志，2013，22(18): 2168-2173.

36)毛黎娟，袁志林，章初龙*. 固相微萃取-气相色谱-质谱法测定内生真菌栎生青霉产生的挥发性有机成分. 理化检验-化学分册, 2013, 49(增刊): 92-96.

37)王国平，王丽薇，张亚磊，王佳莹，徐旭辉，章初龙*. 一株银杏内生真菌的鉴定及其活性代谢产物研究. 中国生物防治学报, 2012, 28(2): 226-234.

38)程敬丽，阮璐璐，陆一夫，章初龙. 内生真菌代谢产物球毛壳菌素A的液相色谱分析. 农药，2011，50(1): 43-45.

39)阮璐璐，程敬丽，陆一夫，章初龙，谭成侠. 球毛壳菌素A发酵工艺优化及有效成分的提取分离. 农药, 2011, 50(12): 884-887.

40)杨冠美，郑永利，吴华新，吴降星，章初龙，林福呈，9种杀菌剂对芸薹生链格孢菌毒力的测定，浙江农业科学，2011（3）：665-668.

41)汪滢，王国平，王丽薇，徐旭辉，夏静，黄雪芳，吴友贵，章初龙。一株多花黄精内生真菌的鉴别及其抗菌代谢产物. 微生物学报2010, 50(8): 1036-1043.

42)王国平，郑必强，周转忠，章初龙。紫杉木霉突变株UL60-11产木霉菌素的发酵条件优化. 中国生物防治, 2010, 26(4): 486-491.

43)王国平，鲁书玲，郑必强，章初龙，林福呈. 内生真菌紫杉木霉ZJUF0986菌株及其活性代谢产物防治水稻纹枯病的效果. 中国生物防治, 2009, 25(1): 30-34.

44)王国平，周转忠，陈雄燕，郑必强，章初龙. 紫杉木霉菌株ZJUF0986原生质体的制备及诱变抗性菌株的选育. 植物保护学报, 2009, 36(5): 397-402.

45)王国平，鲁书玲，郑必强，章初龙. 紫杉木霉ZJUF0986代谢产物及其对番茄灰霉病的抑制作用. 浙江农业学报2008/02

46)王国平，郑必强，章初龙，林福呈. 内生真菌ZJUF0986代谢的抗菌活性物质特性. 植物保护学报2008/04

47)章初龙，王国平，郑必强，陈绍瑗，林福呈. 紫杉木霉ZJUF0986抗真菌活性代谢产物分离提取及其活性研究. 菌物学报，20080515，第3期

48)袁志林，陈益存，章初龙，林福呈，陈连庆. 中国木霉属内生真菌一个新记录种Trichoderma chlorosporum(英文). 菌物学报2008/04

49)袁志林，章初龙，林福呈。植物与内生真菌互作的生理与分子机制研究进展.生态学报，20080915，28(9): 4430-4439.

50)刘小红，张福生，王国平，陈锋，章初龙，林福呈. ZJUF0986活性代谢产物对稻瘟病菌致病性的影响. 植物保护学报，2008，35(6): 481-485.

51)傅科鹤，章初龙，刘树蓬，陈绍瑗，林福呈. 南方红豆杉内生真菌的抗菌活性.植物保护学报, 2006, 33(3): 268-272.

52)闫章才，温明章，李艳，章初龙. 我国微生物学基础研究现状及展望. 中国科学基金, 2005/01

53)章初龙，徐同. 我国河北、浙江、云南及西藏木霉种记述. 菌物学报, 2005,第2期

54)林福呈，刘小红，王洪凯，章初龙。紫杉醇及其产生菌的研究现状与展望。微生物学报-2003:43(4)-534-538。

55)章初龙，徐同。Trichoderma harzianum及其近缘种的分子系统学研究。《生物多样性》2003年第1期

56)邹成，杨迪生，章初龙，林福呈。一种从真菌中提取的新的软组织肉瘤化疗药物。国外医学：骨科学分册-2003:24(3)-187-187。

57)章初龙，徐同。木霉属及其有性型分类学与分子系统学研究进展。《浙江大学学报：农业与生命科学版》2003年第4期

58)章初龙，徐同。木霉属Trichoderma组和Pachybasium组的分子系统学研究。《菌物系统》2002年第4期

59)申铉珠，徐同，章初龙，陈竹君。韩国与中国的辣椒炭疽病菌菌株比较研究(英文) 浙江大学学报(农业与生命科学版) 2000/06

60)章初龙，徐同。木霉属分类研究进展云南农业大学学报2000/03

61)章初龙郑重。水稻恶苗病菌的遗传多样性研究《浙江农业大学学报》1998年第6期

62)王拱辰，章初龙，郑重。镰孢属李瑟组研究──促进李瑟组产孢的植物组织培养基浙江大学学报(农业与生命科学版) 1995/06

2.专利

1)夏琛，徐清泉，周国俊，金慧清，张勇刚，吴键，李永生，章初龙，林福呈，刘宏玉，刘凝，冯晓晓，内生真菌菌株YCEF193及其用途，国家发明专利，ZL201410071732.X，授权公告日：2015.09.02

2)徐清泉，章初龙，林福呈，刘宏玉，刘凝，冯晓晓，夏琛，程昌合，金慧清，刘化冰，张晓兵，何文苗，慕继瑞，内生真菌菌株YCEF199及其用途，国家发明专利，ZL201410071743.8，授权公告日：2015.09.02

3)林福呈，刘诚，章初龙，冯晓晓，真菌固体发酵法，ZL2013101110485，授权公告日：2015.07.08

4)金慧清，章初龙，林福呈，刘宏玉，刘凝，冯晓晓，徐清泉，吴继忠，解莹莹，朱书秀，斯文，项波卡，内生真菌菌株YCEF191及其用途，201410072817X，授权公告日：2015.07.08

5)冯晓晓，刘诚，章初龙，林福呈，真菌固体发酵培养基，国家发明专利，ZL201310110973.6（授权公告日2015年03月25日）

6)冯晓晓，苏珍珠，章初龙，林福呈，内生真菌菌株RR19及其用途，2013100475631，授权公告日：2014.10.08

7)王国平，章初龙，汪贤玉，关卫军，周转忠，鲍志娟，兰金林，鲁高明，徐旭辉，刘思鹏，含嘧霉胺的杀菌剂组合物，2013100933767，授权公告日：2014.07.16

8)苏珍珠，林福呈，章初龙，冯晓晓，内生真菌菌株S22及其用途，国家发明专利，ZL201310047818.4（授权公告日2014.7.02）

9)章初龙，冯晓晓，苏珍珠，林福呈，内生真菌菌株RR21及其用途，国家发明专利，ZL201310047454.X（授权公告日2014.6.18）

10)章初龙，林福呈，冯晓晓，李颖，炭角菌菌株及其用途，国家发明专利ZL201210104997.6（授权公告日2014.4.16）

11)苏珍珠，章初龙，林福呈，冯晓晓，内生真菌菌株SS1及其用途，国家发明专利，ZL201310047521.8（授权公告日2014.4.16）

12)王国平，章初龙，林福呈，夏静，周转忠，拟茎点霉属内生真菌及其用途，国家发明专利ZL201010600416.9（授权公告日2013.6.12）

13)王国平，章初龙，林福呈，王丽薇，冯晓晓，茎点霉菌株及其用途，国家发明专利ZL201110080186.2（授权公告日2013.6.12）

14)王国平，章初龙，林福呈，毛黎娟，周转忠，杀菌剂，国家发明专利ZL201110068240.0（授权公告日2013.2.13）

15)林福呈，王国平，章初龙，毛黎娟，周转忠，Muscodor sp.属植物内生真菌ZJLQ024及其用途和杀菌剂，国家发明专利ZL200910153512.0（授权公告日2012年7月4日）

16)王国平，章初龙，林福呈，毛黎娟，周转忠，Muscodor属植物内生真菌及其用途和杀菌剂，国家发明专利ZL200910153513.5（授权公告日2012年7月4日）

17)赵金浩，程敬丽，周勇，徐旭辉，王国平，章初龙，林福呈，朱国念，木霉菌素类衍生物及其防治病原菌的用途，国家发明专利ZL201010117859.2（授权公告日2012年2月29日）

18)程敬丽，赵金浩，周勇，王国平，章初龙，林福呈，朱国念，木霉菌素衍生物及其用途，国家发明专利ZL200810162582.8，授权公告日：2012.01.11

19)王国平，郑必强，章初龙，林福呈，木霉菌酯素的提纯方法，国家发明专利ZL200710156394.X（授权公告日2011年10月12日）

20)章初龙，王国平，林福呈，毛黎娟，周转忠，Muscodor属植物内生真菌ZJLQ070及其用途和杀菌剂，国家发明专利ZL200910153511.6（授权公告日2011年10月12日）

21)章初龙，林福呈，袁志林，一种真菌菌株及其用途，国家发明专利ZL200810162535.3（授权公告日2011.05.04）

22)王国平，郑必强，章初龙，林福呈，发酵生产木霉菌酯素所用的发酵培养基，国家发明专利ZL200710156393.5（授权，授权公告日2011.01.12）

23)林福呈，凌民，章初龙，闵航，一种城市生活垃圾综合处置方法，国家发明专利ZL200810062151.4（授权公告日2010年12月15日）

24)章初龙，王国平，郑必强，林福呈，安全便携式液体菌种接种装置，国家发明专利ZL200710071011.9（授权公告日2010年11月17日）

25)陈绍瑗，黄超，章初龙，林福呈，一种角毛壳菌株及其用途，国家发明专利ZL200910098473.9（授权公告日2010.11.17）

26)林福呈，凌民，章初龙，闵航，一种垃圾发酵专用装置及垃圾发酵法，国家发明专利ZL200810062152.9（授权公告日2010.09.09）

27)章初龙，陈绍瑗，林福呈，王立君，具有抗真菌活性的喹啉衍生物及其制备方法，国家发明专利ZL200810162583.2（授权公告日2010.09.08）

28)章初龙，陈绍瑗，林福呈，一种节菱孢菌株及其用途，国家发明专利ZL200810061331.0（授权公告日2010.06.09）

29)林福呈，章初龙，陈绍瑗，一种紫杉木霉菌株及其在制备木霉菌酯素中的用途，国家发明专利，ZL200710106257.5（授权公告日2010.04.21）

30)卢建平，吕琴，章初龙，林福呈，冯晓晓，源于稻瘟病菌的真菌致病性基因MNH6及其用途，国家发明专利ZL200710067275.7（授权公告日2010.02.24）

31)林福呈，章初龙，陈绍瑗，一种真菌菌株及其用途，国家发明专利，ZL200510050245.6（授权公告日2006.12.20）

3.奖励

1)稻瘟病菌细胞自噬的研究. 高等学校自然科学二等奖，2013年，4/5

2)从分布模式到生态学过程：百山祖冷杉内生真菌物种多样性和功能多样性.浙江省自然科学学术奖，二等奖，2012年11月，4/4

3)中国的木霉多样性：木霉种在东亚从北到南分布的证据. 浙江省自然科学学术奖，三等奖，2010年10月，1/4