本实验室团队先后承担20余项国际、国家和省部级项目的研究工作，包括主持8项国家自然科学基金，1项转基因重大专项重点课题，1项教育部新世纪优秀人才支持计划，1项瑞典国际科学基金（IFS），1项霍英东高等院校青年教师基金，1项浙江省自然科学基金杰出人才团队项目, 以及1项浙江省自然科学基金重点项目的研究工作。另外，作为参加单位负责人承担转基因重大专项重点课题1项；作为骨干人员参加2项973项目课题、2项农业部公益性行业项目，以及1项教育部长江学者和创新团队发展计划项目等的研究工作。其中，近期先后承担的部分项目清单如下：

2. AGO基因家族对菌核病（Sclerotinia sclerotiorum）抗性的调控功能解析，国家自然科学基金，2014.1~2017.12

3. 番茄抗叶霉病基因Cf-4和Cf-9的转录调控分子机理解析，浙江省自然科学基金重点项目，2012.1-2015.12

4. RNA沉默对植物菌核病（Sclerotinia sclerotiorum）抗性的调控功能分析，教育部高等学校博士学科点专项科研基金，2012.1-2014.12

5. 油料作物菌核病综合防控技术研究与示范推广，公益性行业（农业）科研专项，2011.1-2015.12    

6. 教育部长江学者和创新团队发展计划项目（周雪平教授主持），2011.1-2012.12

7. 作物新品种培育及动物消化系统研究（张国平教授主持），浙江大学基本科研业务费专项（校长专项），2011.3-2013.2

8. 水稻细菌病害抗性调控基因的分离鉴定与功能验证，转基因生物新品种培育重大专项重点课题，2009.6~2011.12

9. 植物与核盘菌（Sclerotinia sclerotiorum）互作分子基础，教育部新世纪优秀人才支持计划，2009.1~2011.12

10. 利用基因沉默技术筛选本氏烟抗Sclerotinia sclerotiorum相关基因，国家自然科学基金，2009.1~2011.12

11. 设施环境下作物抗病抗虫性的表达和调控以及抗性定向诱导的分子机制，973课题，骨干人员，2009.1~2013.12

12. DCL在DNAmβ诱导的基因沉默和抗TYLCCNV病毒中的功能分析, 国家自然科学基金，2008.1~2010.12,

13. 植物泛素延伸蛋白的抗病功能和机理分析及其在广谱抗病育种中应用潜力的评估，浙江省自然科学基金杰出青年团队项目，2008.1~2010.12

14. 通过基因沉默鉴定番茄与叶霉菌互作下游信号传导途径的重要基因及其功能分析，国家自然科学基金，2007.1~2009.12

15. 农作物重要病毒致病的分子机理与病害流行分子基础，973课题，骨干人员，2006.10~2011.9

16. 植物抗病关键基因克隆和鉴定的新方法体系及其有效性验证，教育部霍英东高等院校青年教师基金，2006.3~2009.3

17. 番茄抗病基因Cf-4和Cf-9下游信号传导的蛋白质组学比较，国家自然科学基金， 2003.1~2005.12