实验室先后主持承担973项目子课题、转基因重大专项重点课题、国家重点研发项目子课题、农业部公益性行业子项目、国家自然科学基金、教育部新世纪优秀人才支持计划项目、瑞典国际科学基金（IFS）、浙江省杰出人才团队项目等20余项国际、国家和省部级项目的研究工作。其中部分项目如下：

1. 国家重点研发计划“化学肥料和农药减施增效综合技术研发”重点专项，2017YFD0200904，高效安全靶标基因筛选及RNAi 作用机制，2017/07-2020/12

2. 浙江省自然科学基金重点项目，LZ18C140002，油菜CNGC基因的抗菌核病调控功能及机制解析，2018/01-2021/12

3. 国家自然科学基金面上项目，31672014，油菜CAMTA3对菌核病抗性的调控功能及机制分析，2017/01-2020/12

4. 转基因生物新品种培育重大专项，2014ZX0800905B，新型抗水稻细菌病害调控基因的发掘和功能验证，2014/01-2016/12

5. 烟草行业重点实验室专项经费课题，CNTC-[2014]334-No.110201302018，烟草抗病毒病调控基因的筛选鉴定，2015/01-2016/12

6. 浙江省自然科学基金重点项目，LZ12C14002，番茄抗叶霉病基因Cf-4和Cf-9的转录调控分子机理解析，2012/01- 2015/12

7. 教育部高等学校博士学科点专项科研基金，20110101110092，RNA沉默对植物菌核病（Sclerotinia sclerotiorum）抗性的调控功能分析，2012/01-2014/12

8. 公益性行业（农业）科研专项，201103016，油料作物菌核病综合防控技术研究与示范推广，2011/01-2015/12

9. 转基因生物新品种培育重大专项，2009ZX08009-044B，水稻重要细菌和病毒病害抗性调控基因及其元件的发掘和功能分析，2009/06-2010/12

10. 教育部新世纪优秀人才支持计划，NCET-08-0485，植物与核盘菌（Sclerotinia sclerotiorum）互作分子基础，2009/01-2011/12

11. 国家重点基础研究发展规划项目（973），2009CB119000，设施作物的环境适应机制与产品安全调控的基础研究，2009/01-2013/12

12. 公益性行业（农业）科研专项, 200803010，梨枯梢病防控技术解决方案研究与示范，2008/01-2010/12  

13. 国家自然科学基金面上项目，30871608，利用基因沉默技术筛选本氏烟抗Sclerotinia sclerotiorum相关基因，2009/01-2011/12   

14. 浙江省自然科学基金杰出青年团队项目，R307396，植物泛素延伸蛋白的抗病功能和机理分析及其在广谱抗病育种中应用潜力的评估，2008/01-2010/12

15. 国家重点基础研究发展规划项目，2006CB101903，农作物重要病毒致病的分子机理与病害流行分子基础，2006/10-2010/09   

16. 国家自然科学基金面上项目，30671352，通过基因沉默鉴定番茄与叶霉菌互作下游信号传导途径的重要基因及其功能分析，2007/01-2009/12   

17. 教育部霍英东教育基金会第十届高等院校青年教师基金，101032，植物抗病关键基因克隆和鉴定的新方法体系及其有效性验证，2006/03-2009/03

18. 国家自然科学基金面上项目，30170597，番茄叶霉菌基因CfHNNI1对植物坏死和抗性的诱导功能分析，2002/01-2004/12   

19. 教育部留学回国人员科研启动基金，教外司留（2001）498号，番茄抗病基因Cf-4和Cf-9介导不同过敏性坏死的机理，2002/01-2003/12   

20. 国家自然科学基金面上项目，30070492，番茄抗叶霉菌基因Cf-4和Cf-9介导抗性表现和机制的比较，2001/01-2003/12      

21. 国家自然科学基金面上项目，39670487，番茄系统性诱导抗病性信号物质的确定，1997/01-1999/12

22. 浙江省自然科学基金，395094，水杨酸在诱导番茄抗病性中的作用和机理，1996/01-1998/12

23. 瑞典国际科学基金（IFS），C/2666-1，番茄GTP结合蛋白在水杨酸信号传导中的作用，1997/09-2000/09