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李飞   教授

 

杭州市西湖区余杭塘路866号

浙江大学紫金港校区农生环组团C座C1223

邮编:310058

邮箱:lifei15@zju.edu.cn

电话:0571-88982679(办公室)

            0571-88982526(实验室)


李  飞

        李飞   博士、教授、博士生导师。1977年1月。1996、2003年分别获南京农业大学学士、博士学位, 2005年清华大学自动化系博士后出站,2006年美国冷泉港实验室访问学者。2005年破格提升为南京农业大学教授,2006年前起任博士生导师。2015年8月起,任浙江大学教授、博士生导师。

        入选浙江大学求是特聘教授、教育部新世纪优秀人才、全国百篇优秀博士论文获得者、江苏省杰出青年基金、浙江省151人才第二层次、江苏省333高层次人才培养工程第三层次、清华大学优秀出站博士后。曾任第四届国际昆虫生理生化学术会议执行主席兼秘书长、第三届国际昆虫基因组大会及第六届国际生理生化学术会议秘书长。

 

InsectBase: http://genome.zju.edu.cn/  http://www.insect-genome.com/

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招聘与招生 

 1)实验室长期招聘昆虫分子生物学、昆虫基因组学和生物信息学博士后,要求工作积极主动,以第一作者发表过SCI收录论文。除浙江大学博士后待遇外,浙江大学高峰学科可每年补助3-5万元,实验室还视工作情况提供额外补助。实验室注重培养博士后独立研究的能力,提供各种学术交流的机会。
 2)每年招收博士生1-2名,硕士生2名,要求富有学习精神,工作踏实努力,沟通能力强。实验室培养昆虫分子生物学和生物信息学紧密结合的交叉学科研究生,在就业市场上具有很强的竞争力,就业前景好,待遇高。研究生有机会系统学习
Linux服务器使用、编程、大数据分析、及分子生物学等多学科技能。根据个人兴趣,可偏重昆虫分子生物学,也可偏重昆虫基因组学和生物信息学方向

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 •研究领域

   1、昆虫基因组学:利用生物信息学技术对重要农业昆虫基因组和转录组等进行数据挖掘,构建昆虫基因数据库,开发相关算法和计算流程,建立综合型基因分析平台。实验室已经开发InsectBase、ChiloDB、iPathDB等数据平台,TripetSVM、OMIGA、iPathCons、LR50、Piano等算法和流程用于基因组注释、转录组分析、miRNA和piRNA预测等。

   2、昆虫非编码RNA基因研究:利用分子生物学技术研究microRNA、piRNA、lncRNA、siRNA等非编码RNA在昆虫发育、繁殖、抗药性等重要性状中的调控功能。实验室重点研究昆虫microRNA基因的转录、进化以及对昆虫发育的调控等。
  

 
承担项目

        先后主持转基因专项1项、973前期预演项目1项、国家自然科学基金5项、教育部科学技术研究项目1项、江苏省人才创新基金1项、国际科学基金1项、博士后基金1项,人才基金3项(教育部新世纪人才,全国百篇优秀博士论文资助金、江苏省杰出青年基金),参加公益性行业项目1项、973项目2项、863项目1项。主要包括:    

1、国家自然科学基金,二化螟microRNA调控蜕皮激素合成的分子机制 (31772238). 2018/01-2021/12. 在研,主持。

2、 浙江省自然科学基金重点项目. miR+信号通路的整合与数据挖掘 (Z18C60003). 2018/01-2021/12. 在研,主持。

3、国家重点研发计划. 高效安全靶标基因筛选及RNAi作用机制 (2017YFD0200904). 2017/07-2020/12. 在研,参加。

4、国家重点研发计划. 重要入侵生物的基因组特性及遗传结构 (2016YFC200602). 2016/07-2018/12. 在研,参加。

5、教育部科学技术研究项目, V201308,二化螟化蛹调控相关基因的功能分析及其在害虫控制中的应用. 2014/01-2016/12已结题、主持

6、国家自然科学基金面上项目. 微小RNA基因在二化螟化蛹和羽化中的调控功能分析 (31171843). 2012/01-2015/12. 已结题、主持 

7、江苏省杰出青年基金项目,二化螟微小基因的功能分析 2012/07-2015/06, 已结题、主持。

8、科技部 973 项目, 2010CB126200. 稻飞虱灾变机理及可持续治理的基础研究.  2010/1-2014/12、已结题、参加。

9、国家自然科学基金面上项目, 30871636. 基于昆虫杆状病毒表达系统的 RNAi 致死体系研究. 2009/01-2011/12. 已结题、主持。

10、农业部转基因专项重点项目, 2009ZX08001-002B. 基于基因沉默的抗灰飞虱转 基因水稻新品系培育. 2009/01-2010/12. 已结题、主持。

11、科技部 973 前期预演项目, 2009CB125902、害虫基因沉默控制的基础研究.  2009/01-2010/12. 已结题、主持。

12、国家自然科学基金面上项目, 30771417、鳞翅目害虫微小 RNA 基因在幼虫发育中的调控功能分析. 2008/01-2010/12. 已结题、主持。

13、江苏省创新人才(学术)基金, BK2007524. 昆虫 microRNA 基因的克隆及其对 生长发育的调控分析. 2007/06-2009/12. 已结题、主持。

14、全国优秀博士论文作者资助金, 200557. 无脊椎动物多个乙酰胆碱酯酶基因的 功能分析与进化研究. 2006/01-2010/12. 已结题、主持。

15、国家自然科学基金青年基金项目,  60405001. 可变外显子和内含子microRNA基因的识别验证及分子进化分析. 2005/01-2007/12、已结题、主持。

16、国际科学基金C/3800-1Identification of physiological and toxicological function of the two acetylcholinesterase genes from cotton aphid with Sindbis virus mediated RNAi technique 2005/01-2007/12. 已结题、主持。

 

 

  • 学术兼职

        中国昆虫学会理事、昆虫生理生化委员会主任

        中国昆虫学会基因组委员会委员

        Frontiers in Non-Coding RNA:Review Editor

        Archives of Insect Biochemistry and Physiology:Guest Editor

        应用昆虫学报 编委

        环境昆虫学报 编委

        生物安全学报 编委

        植物保护学报 编委

 
教学工作

        先后主讲《植保生物技术》、《昆虫分子生物学》、《昆虫基因组学》和《高级生物信息学》

        至今已经培养博士8名、硕士35名,毕业研究生主要在大学、研究所及出入境检验检疫系统等单位工作,多人在业内具有重要影响力的大公司担任管理人员和技术骨干。


获奖成果

        教育部自然科学二等奖(第四完成人)

  
研究论文

2017

Xinhai Ye, Liwen Yang, David Stanley, Fei Li & Qi Fang. Two Bombyx mori acetylcholinesterase genes inuence motor control and development in dierent ways. Scientific Reports, 2017, 7:4985【Download

Dianhao Guo, Jiapeng Luo, Yuenan Zhou, Huamei Xiao, Kang He, Chuanlin Yin, Jianhua Xu and Fei Li. ACE: an efficient and sensitive tool to detect insecticide resistance-associated mutations in insect acetylcholinesterase from RNA-Seq data. BMC Bioinformatics, 2017, 18(1): 330【Download

Yang Sun, Shujin Huang, Shuping Wang, Dianhao Guo, Chang Ge, Huamei Xiao, Wencai Jie, Qiupu Yang, Xiaolu Teng, Fei Li. Large-scale identification of differentially expressed genes during pupa development reveals solute carrier gene is essential for pupal pigmentation in Chilo suppressalis. Journal of Insect Physiology, 2017, 98:117.   【Download

尹传林,李美珍,贺康,丁思敏,郭殿豪,席羽,李飞昆虫基因组及数据库研究进展环境昆虫学报, 2017, 39(1):1-18.【Download

肖花美,李美珍李飞. 昆虫长链非编码RNA的研究进展应用昆虫学报, 2017, 54(1):1-12.【Download

马行洲李飞miRNA调控昆虫精巢干细胞自我更新相关基因的保守性分析和靶标验证昆虫学报, 2017, 60(8): 847-856   【Download


2016

Kang He, Kejian Lin, Guirong Wang and Fei Li. Genome Sizes of Nine Insect Species Determined by Flow Cytometry andk-mer Analysis. Frontiers in Physiology, 2016, 7:569    【Download

Cuicui Su, Gongming Tu, Shuijin Huang, Qiupu Yang, Muhammad Faisal Shahzad, Genome-wide analysis of chitinase genes and their varied functions in larval moult, pupation and eclosion in the rice striped stem borer, Chilo suppressalis. Insect Molecular Biology, 2016, 25 (4):401-412. View online

Chuanlin Yin,  Gengyu Shen, Dianhao Guo, Shuping Wang, Xingzhou Ma, Huamei Xiao, Jingding Liu, Zan Zhang, Ying Liu, Yiqun Zhawng, Kaixiang, Yu, Shuiqing, Huang, Fei Li. InsectBase: a resource for insect genomes and transcriptomes. Nucleic Acids Research, 2016, 44:D801-D807 View online


2015

Lin He, Gengyu Shen, Fei Li, Shuiqing Huang, Automatic extraction of reference gene from literature in plants based on texting mining. Int. J. Data Mining and Bioinformatics, 2015, 12 (4): 400-416

Jiao Zhang, Yanru Xing, Yao Li, Chuanlin Yin, Chang Ge, Fei Li. DNA methyltransferases have an essential role in female fecundity in brown planthopper, Nilaparvata lugens. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2015, 464: 83-88 【View online

Tao He, Wenjie Lei, Chang Ge, Peng Du, Li Wang, Fei Li. Large-scale detection and analysis of adenosine-to-inosine RNA editing during development in Plutella xylostella. Molecular Genetics and Genomics, ,290 (3):929-937 View online

Yihan Xia, Yanan Zhang, Xiaoqing Hou, Fei Li, Shuang-Lin Dong. Large number of putative chemoreception and pheromone biosynthesis genes revealed by analyzing transcriptome from ovipositor-pheromone glands of Chilo suppressalis. Scientific Reports, 2015, doi:10.1038/srep07888【View online

王颖, 王甦,张帆,李飞. 浅黄恩蚜小蜂寄生对烟粉虱海藻糖含量、酶活 和热激蛋白表达水平的影响. 中国生物防治学报, 2015, 31(3):297-304


2014

Kai Wang, Chun Liang, Jinding Liu, Huamei Xiao, Shuiqing Huang, Jianhua Xu, Fei Li. Prediction of piRNAs using transposon interaction and a support vector machine. BMC Bioinformatics, 2014, 15:419View online

Jinding Liu, Huamei Xiao, Shuiqing Huang, Fei Li. OMIGA: Optimized Maker-Based Insect Genome Annotation. Molecular Genetics and  Genomics, 2014, 289:567–573 【View online

Zan Zhang, Chuanlin Yin, Ying Liu, Wencai Jie, Wenjie Lei, Fei Li. iPathCons and iPathDB: an improved insect pathway construction tool and the database. Database, 2014, Vol. 2014: article ID bau105.【Download

Chuanlin Yin, Ying Liu, Jingding Liu, Huamei Xiao, Shuiqing Huang, Yongjun Lin, Zhaojun Han, Fei Li. ChiloDB: a genomic and transcriptome database for an important rice insect pest Chilo suppressalis. Database, 2014, Vol. 2014: article ID bau065.【Download

Zan Zhang, Xiaolu Teng, Maohua Chen, Fei Li. Orthologs of Human Disease Associated Genes and RNAi Analysis of Silencing Insulin Receptor Gene in Bombyx mori. Int. J. Mol. Sci. 2014, 15, 18102-18116.【Download

Muhammad Faisal Shahzad, Yao Li, Chang Ge, Yang Sun, Qiupu Yang, Fei Li. Knockdown of Cs-Spook induces delayed larval molting in rice stem borer, Chilo suppressalis, Archives of Insect Biochemistry and Physiology, 2015, 88 (3): 179–191.【View online

Baoju Wang, Muhammad Faisal Shahzad, Zan Zhang, Haina Sun, Ping Han, Fei Li, Zhaojun Han. Genome-wide analysis reveals the expansion of Cytochrome P450 genes associated with xenobiotic metabolism in rice striped stem borer, Chilo suppressalis. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2014, 443: 756–760 .【View online


2013

Yonglei Liu, Muhammad Faisal Shahzad, Lan Zhang, Fei Li, Kejian Lin. Amplifying long transcripts of ryanodine receptors of five agricultural pests by transcriptome analysis and gap filling. Genome, 2103, 56: 651–658.【View online

Hang Li, Weihau Jiang, Zan Zhang, Yanru Xing, Fei Li. Transcriptome Analysis and Screening for Potential Target Genes for RNAi-Mediated Pest Control of the Beet Armyworm, Spodoptera exigua. PLoS ONE, 2013, 8(6): e65931 【View online

刘金定, 李飞. 丽蝇蛹集金小蜂P450基因家族的发现和分子进化分析.中国生物防治学报, 2013,29(4): 490-496.

刘金定, 张赞, 黄水清, 李飞. 昆虫RNA-Seq数据的分析流程. 应用昆虫学报, 2013, 50(5):1458-1468. 

陈爱玲, 林克剑, 贺康, 王桂荣, 李飞. 灰飞虱体内水稻条纹病毒基因的 RNA 干扰效应. 中国农业科学 2013, 46(6):1158-1165 

王娜, 郎志飞, 贺康, 李飞. 河北邢台和江苏南京地区棉蚜对丁硫克百威和吡虫啉的抗性.中国农业科学,2013, 46 (16): 3377-3383 


2012

Fei Li, Fei Ma, Xinglai Ji, Guoqing Li, Zhaojun Han. Methods for identifying  small RNA genes. Advances of insect physiology. 2012, 42:155-197 (Invited review)

刘莹, 王娜, 张赞, 李飞. 五种鳞翅目害虫中抗药性相关基因的转录组学分析. 应用昆虫学报, 2012, 49( 2):317-323 

张赞, 刘金定, 黄水清, 李飞. 生物信息学在昆虫学研究中的应用. 应用昆虫学报, 2012, 49( 1) :1-11 


2011

Xiaoming Hui, Liwen Yang, Guiling He, Qiupu Yang, Zhaojun Han, Fei Li. RNA interference of ace1 and ace2 in Chilo suppressalis reveals their different contributions to motor ability and larval growth, Insect Molecular Biology. 2011, 20(4): 507-518【View online

Qidong Jia, Kejian Lin, Jindong Liang, Lun Yu, Fei Li. Discovering conserved insect microRNAs from expressed sequence tags. Journal of Insect Physiology. 56 (2010) 1763–1769【View online


2010

Jinjun Qian, Zan Zhang, Jingdong Liang, Qiongqiong Ge, Xuchu Duan, Fei Ma, Fei Li. The full-length transcripts and promoter analysis of intergenic microRNAs in Drosophila melanogaster. Genomics, 2010, 97:294-303.【View online

Zhen Liao, Qidong Jia, Fei Li, and Zhaojun Han. Identification of two piwi genes and their expression profile in honeybee, Apis mellifera. Archives of Insect Biochemistry and Physiology, 2010, Vol. 74, No. 2, 91–102.【View online

李飞, 吴益东,韩召军. 害虫的基因沉默控制.昆虫知识, 2010,47(5): 819- 823


2009

Yalong Xu, Peng He, Lan Zhang, Shaoqing Fang, Shuanglin Dong, Yongjun Zhang, Fei Li. Large-scale identification of odorant-binding proteins and chemosensory proteins from expressed sequence tags in insects. BMC genomics. 2009, 10:632 (Citations: 50 times).

Xue Zhou, Xuchu Duan, Jinjun Qian, Fei Li. Abundant conserved microRNA target sites in the 5’-untranslated region and coding sequence. Genetica, 2009, 137:159–164.【View online

Huiping Xiong, Jinjun Qian, Tao He, Fei Li.Independent transcription of miR-281 in the intron of ODA in Drosophila melanogaster. Biochemical and Biophysical Research Communications. 378 (2009) 883-889. 【View online


2008

Xue Zhou, Yalong Xu, Luogen Cheng, Fei Li. Computational identification and evolutional analysis of Piwi subfamily in 11 Drosophila species. Insect Science (2008) 15:537-544.【View online

Yong Zhang, Xue Zhou, Xie Ge, Jianhao Jiang, Muwang Li, Shihai Jia, Xiaonan Yang, Yunchao Kan, Xuexia Miao, Guoping Zhao, Fei Li, Yongping Huang. Insect-Specific microRNA Involved in the Development of the Silkworm Bombyx mori. PLoS ONE, 2008, 4(3): e4677.【View online

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2007

Tingting Li, Fei Li, Xuegong Zhang. Prediction of kinase-specific phosphorylation sites with sequence features by a log-odds ratio approach Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 2007, 70(2):404-414【View online

Xue Zhou, Zhen Liao, Qidong Jia, Luogen Cheng, Fei Li.  Identification and characterization of Piwi subfamily in insects. Biochemical and Biophysical Research Communications. 362 (2007) 126–131.【View online


2005

Chenghai Xue* , Fei Li* , Tao He , Guo-ping Liu , Yanda Li  and Xuegong Zhang. Classification of real and pseudo microRNA precursors using local structure-sequence features and support vector machine. BMC Bioinformatics. 2005, 6:310 (* contributed equally, Citations: 198 times). 【View online

Jun Cai , Ying Huang, Fei Li, Yanda Li. Alteration of protein subcellular location and domain formation by alternative translational initiation. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 2005,62(3): 793-799 【View online

Xiaowo Wang, Jing Zhang, Fei Li, Jin Gu, Tao He, Xuegong Zhang, Yanda Li, MicroRNA identification based on sequence and structure alignment, Bioinformatics, 2005, 21(18): 3610-3614. (Citations: 167 times)【View online


2004

Jing Zhang, Fei Li, Jun Li, Michael Q. Zhang, Xuegong Zhang. Evidence and Characteristics of Putative Human Alpha Recombination Hotspots. Human Molecular Genetics, 2004, 13(22), 2823-2828 (IF: 6.393) 【Download

Fang Wen*, Fei Li*, Huiyu Xia, Xin Lu, Xuegong Zhang, Yanda Li. The impact of very short alternative splicing on protein structures and functions in the human genome. Trends in Genetics. 2004, 20(5):232-236 (* contributed equally, IF: 9.918).【View online

Fei Li, Zhaojun Han. Mutations in acetylcholinesterase associated with insecticide resistance in the cotton aphid, Aphis gossypii Glover.  Insect biochemistry and molecular biology. 2004, Vol 34, 397-405 (Citations: 78 times)【View online


2003

李飞,韩召军. 抗性品系棉蚜乙酰胆碱酯酶和羧酸酯酶的变异. 昆虫学报. 2003, 46(5):578-583

李飞,黄水金,韩召军.害虫抗药性分子检测技术. 生命的化学. 2003, 23 (5):392-395


2002

Fei Li, Zhaojun Han. Two Different Genes Encoding Acetylcholinesterase Existing in cotton aphid, Aphis gossypii Glover. Genome. 2002, 45 (6):1134-1141. (Citations: 66 times )【View online

Fei Li, Zhaojun Han. Purification and Characterization of Acetylcholinesterase from Cotton Aphid, Aphis gossypii Glover.  Archives of Insect Biochemistry and Physiology. 2002, 51(1): 37-45 (Citations: 51 times)【View online

李飞,韩召军. 棉蚜羧酸酯酶同工酶cDNA片段的基因克隆和序列分析. 棉花学报,2002, 14 (6):336-339

李飞,韩召军,吴智锋. 取食不同寄主棉蚜羧酸酯酶和乙酰胆碱酯酶特性的比较. 南京农业大学学报. 2002, 25(2): 57-60

李飞,韩召军. 棉蚜钠离子通道基因cDNA和基因组DNA片段的克隆和序列分析. 武夷科学. 2002, 18: 86-92


2001

李飞,韩召军.棉蚜饲养技术—笼罩法. 昆虫知识. 2001, 38 (3): 225-227